Дед Мороз из Домодедовского карьера Офигеология без границ
счетчик посещений

Реквием по программе "Пикотех" "учёного" А.Ю.Кушелева

     Вы "ждете от козла молока". Я не умею писать такие программы. Нужен коллектив программистов того же уровня, что писали HyperChem.

Кушелев А.Ю. 22 июня 2014 года.

     Кушелев:

     В настоящее время создана программа Пикотех, которая может показать структуру большинства белков по их кодирующей (нуклеотидной) последовательности.

     Кому интересно узнать структуру белка по коду, а вручную считать утомительно, предлагаем воспользоваться нашей компьютерной программой. Программа написана на стандартном Паскале и позволяет преобразовать генетический код белка в композиционный код его структуры, согласно нашей таблице.

Victoria:

      Сама идея использования кольцегранных моделей для построения пространственных структур белков оказалась плодотворной.

      Однако её реализация А.Ю. Кушелевым нагородила гору описок, оговорок и неточностей, вызывающих конструктивную критику и справедливое негодование научной общественности.

     Кушелев:

     Нужно иметь очень веские аргументы, чтобы не заметить эффективной работы программы "Пикотехнология".

      Возражения должны быть подкреплены если не статистическими, то хотя бы одиночными данными, в противном случае они будут выглядеть просто голословными и неубедительными.

Чтобы аргументы были убедительными, предоставим слово самому Кушелеву А.Ю.

     Кушелев:

     Что касается программы "Пикотех", то она ещё не доделана. Она может строить только каркас, т.е. отрезки, соединяющие характерные точки аминокислотных остатков. Насаживать на этот каркас аминокислотные остатки не получилось, т.к. модули, из которых собирался каркас, не совпадает с аминокислотным остатком, на что Вы обратили моё внимание, а я про это забыл и не объяснил программисту.

     Модуль в программе "Пикотех" составлен из атомов, принадлежащих РАЗНЫМ аминокислотным остаткам. А я забыл сказать об этом программисту. И он запрограммировал "насаживание" на каркас с ошибкой. Теперь эту ошибку можно исправить. Только программиста осталось найти...

Заметим, что ошибся именно Кушелева А.Ю., давший неверную информацию программисту.

     Раньше я действительно предполагал, что углом поворота управляет третий символ триплета, но позднее я узнал о вариабельных петлях и понял, что угол поворота зависит от всех трёх символов триплета. Пикотехнология реализована только на уровне геометрического алгоритма. Взаимодействие молекул пока не реализовано.

Если бы программа-скрипт для 3D Studio была бы завершённой, т.е. без ошибок, то всё это можно было бы сделать в одной программе (3D Studio).

      К сожалению, эта версия "Пикотех" пока содержит ошибки, поэтому лучший вариант, как я Вам говорил с самого начала, это связать модели из пластмассовых колец и снимать на видео для выкладывания на сервер и демонстрации собеседникам на форумах.

Получается Кушелев уже понял, что программа "Пикотех" не может конкурировать с ручной сборкой моделек из колечек!

Модель собраная вручную

Эта модель насчитывает порядка 8000 колец. Сделана за месяц. А модели из пары десятков остатков можно сделать за неделю. При этом такая модель несоизмеримо круче компьютерной.
В энциклопедии Наномир допущена неточность. Там написано: "Формы аминокислот", а на самом деле показаны формы аминокислотных остатков.
Как ориентированы магнитные полюса в живой клетке, я не знаю, поэтому пока приходится "случайно выбирать условную периодичность", но будущие эксперименты позволят сказать точно.

Кольцегранная модель лизоцима, собранная вручную, получилась автоматически.


Весьма забавное представление об автоматических процессах!!

Таким конструктором смогут развлекаться не только дети и их родители, но и профессионалы.
Правильнее было бы сказать, что таким конструктором могут
развлекаться не профессионалы, а именно дети.


Далее последовало забавное продолжение. 1 ноября 2009 года Кушелев А.Ю. на своём форуме неожиданно заявил.

У меня есть не только проекты, но и готовые продукты, например, программа "Пикотех", которую можно продавать уже сегодня
А ведь ещё 7 сентября 2009 года Кушелев А.Ю. утверждал совсем другое.

Кушелев: Что касается программы "Пикотех", то она ещё не доделана. Она может строить только каркас, т.е. отрезки, соединяющие характерные точки аминокислотных остатков. Насаживать на этот каркас аминокислотные остатки не получилось, т.к. модули, из которых собирался каркас, не совпадает с аминокислотным остатком.
Что же произошло? Ведь программа "Пикотех" как была недоделанной, так и осталась. Нет, это не ошибка, это просто выдача желаемого за действительное.


Кушелев: Конечно, новые версии программы "Пикотех" придётся создавать, но это уже отдельный разговор.

Да, конечно, после покупки недоделанной программы наивным инвестором придётся доделывать этот полуфабрикат, а то по судам затаскают.

Только программиста осталось найти...
********************************************************************
    5 февраля 2010 года от Кушелева А.Ю. была получена дополнительная информация.
   Кушелев: Предлагаю Вам начать с 2D-версии программы "Пикотех".
   К сожалению, эта программа работает не на всех компьютерах, т.к. была написана более 10 лет тому назад.
   Есть более современная версия этой программы, но она постоянно исчезает с сервера. Вот и сейчас я пытаюсь её запустить, но ... опять с ней что-то случилось...
   3D-версии программы "Пикотех" до конца не отлажены.
   Вариант программы "Пикотех"-3D от Сергея Захарова.
   Вариант программы "Пикотех"-3D от Дениса Савина.
Получается, что программы не отлажены, устарели и, самое главное - автор не Кушелев, а Сергей Захаров и Денис Савин.
*****************************
© 2009 "Офигеология без границ"
Hosted by uCoz